<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">urovest</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Вестник урологии</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Urology Herald</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="epub">2308-6424</issn><publisher><publisher-name>Rostov State Medical University</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.21886/2308-6424-2019-7-4-13-19</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">urovest-279</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Бактериально-вирусная микробиота мочи при неосложнённой рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей (пилотное исследование)</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Bacterial-viral Urine Microbiota in Uncomplicated Recurrent Infection of the Lower Urinary Tract: Results of Pilot Study</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-0937-4573</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Набока</surname><given-names>Ю. Л.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Naboka</surname><given-names>Ju. L.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Юлия Лазаревна Набока – д.м.н., профессор; заведующая кафедрой микробиологии и вирусологии №1</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Yulia L. Naboka – M.D., Dr.Sc.(M), Full Professor; Head, Dept.of Microbiology and Virology №1</p></bio><email xlink:type="simple">nagu22@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1710-0169</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Коган</surname><given-names>М. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kogan</surname><given-names>M. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Михаил Иосифович Коган – Заслуженный деятель науки РФ, д.м.н., профессор; заведующий кафедрой урологии и репродуктивного здоровья человека с курсом детской урологии-андрологии</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Mikhail I. Kogan – Honored Scientist of Russian Federation, M.D., Dr.Sc.(M), Full Professor; Head, Dept. of Urology and Human Reproductive Health (with the Pediatric Urology and Andrology course)</p></bio><email xlink:type="simple">dept_kogan@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-7924-4945</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Морданов</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Mordanov</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Сергей Викторович Морданов – к.м.н., ассистент кафедры гематологии и трансфузиологии с курсом клинической лабораторной диагностики, генетики и лабораторной генетики</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sergey V. Mordanov – M.D., Cand.Sc.(M), Assistant, Dept. of Hematology and Transfusiology with a Сourse of Сlinical Laboratory Diagnostics, Genetics and Laboratory Genetics</p></bio><email xlink:type="simple">labmed@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-2954-842X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ибишев</surname><given-names>Х. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ibishev</surname><given-names>Kh. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Халид Сулейманович Ибишев – д.м.н., доцент; профессор кафедры урологии и репродуктивного здоровья человека с курсом детской урологии-андрологии</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Khalid S. Ibishev – M.D., Dr.Sc.(M), Associate Professor (Docent), Professor, Dept. of Urology and Human Reproductive Health (with the Pediatric Urology and Andrology Course)</p></bio><email xlink:type="simple">ibishev22@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-8433-8567</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ильяш</surname><given-names>А. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ilyash</surname><given-names>A. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Анна Владимировна Ильяш ‒ к.м.н.; ассистент кафедры урологии и репродуктивного здоровья человека с курсом детской урологии-андрологии</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Anna V. Il’yash ‒ M.D., Cand.Sc.(M), Assistant, Dept. of Urology and Human Reproductive Health (with the Pediatric Urology and Andrology Course)</p></bio><email xlink:type="simple">annailyash@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0995-7848</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гудима</surname><given-names>И. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gudima</surname><given-names>I. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Гудима Ирина Александровна – к.м.н., доцент; доцент кафедры микробиологии и вирусологии № 1</p><p>тел.: +7 (903) 406-65-16</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Irina A. Gudima – M.D., Cand.Sc.(M), Associate Professor (Docent); Associate Professor, Dept. of Microbiology and Virology №1</p><p>tel.: +7 (903) 406-65-16</p></bio><email xlink:type="simple">nagu22@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» МЗ РФ</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Rostov State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2019</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>03</day><month>01</month><year>2020</year></pub-date><volume>7</volume><issue>4</issue><fpage>13</fpage><lpage>19</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Набока Ю.Л., Коган М.И., Морданов С.В., Ибишев Х.С., Ильяш А.В., Гудима И.А., 2020</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Набока Ю.Л., Коган М.И., Морданов С.В., Ибишев Х.С., Ильяш А.В., Гудима И.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Naboka J.L., Kogan M.I., Mordanov S.V., Ibishev K.S., Ilyash A.V., Gudima I.A.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.urovest.ru/jour/article/view/279">https://www.urovest.ru/jour/article/view/279</self-uri><abstract><sec><title>Введение</title><p>Введение. Сложности в ведении и лечении пациенток с неосложнённой рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей (НМП) во многом связаны с тем с тем, что в этиологической структуре заболевания остаются недоизученными бактериальная, вирусная и другие составляющие.</p></sec><sec><title>Цель исследования</title><p>Цель исследования. Изучить бактериально-вирусные ассоциации в моче при неосложнённой рецидивирующей инфекции НМП.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. В исследование вошли 14 пациенток с неосложнённой рецидивирующей инфекции НМП, средний возраст ‒ 33,0 ± 4,7 года. Объектом исследования являлась средняя порция утренней мочи, собранная до назначения эмпирической антибактериальной терапии. Мочу делили на 3 аликвоты: 1 – для общего анализа мочи, 2 – для бактериологического исследования, 3 – для постановки полимеразной цепной реакции (ПЦР).</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. В моче во всех случаях обнаружены аэробно-анаэробные ассоциации. Представители семейства Enterobacteriaceae регистрировали в 92,8% наблюдений, они были представлены E. coli (78,6%), Klebsiella spp. (14,2%), Proteus spp. (7,1%). Причём у одной пациентки одновременно (7,1%) из мочи выделяли E. coli + Klebsiella spp.</p><p>Паттерн грампозитивной микрофлоры состоял из 7 родов и/или видов и в различных комбинациях его обнаруживали у всех пациенток. Таксономическая структура грампозитивной флоры была представлена: E. Faecalis (64,3%), S. lentus (21,4%), Corynebacterium spp., S. warneri, E. faecium (по 14,3%), S. epidermidis + E. coli регистрировали у 4 (28,6%) женщин, E. faecalis + E. faecium + E. coli + Klebsiella spp. – у 1 (7,1%), E. faecalis + E. faecium + E. Coli также у 1 (7,1%) пациентки.</p><p>Неклостридиальные анаэробные бактерии (НАБ) выделяли из мочи во всех наблюдениях при доминировании Eubacterium spp. (57,1%). Таксономическая структура НАБ была представлена 5 родами: Eubacterium spp., Peptostreptococcus spp., Peptococcus spp., Bifidobac-terium spp., Propionibacterium spp.</p><p>Вирусы выявили в моче у 6 (42,9%) пациенток. У 4 (28,6%) из них обнаружен вирус Эпштейна-Барра (EBV), причём в 1 случае в ассоциации с вирусом папилломы человека (HPV53), в двух других случаях (по 7,1%) верифицировали цитомегаловирус (CMV) и вирус герпеса человека типа 6 (HHV6) соответственно.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Introduction</title><p>Introduction. Difficulties in the management and treatment of patients with uncomplicated recurrent lower urinary tract infection (LUTI) are largely because bacterial, viral and other components remain unexplored in the etiological structure of the disease.</p></sec><sec><title>Purpose of the study</title><p>Purpose of the study. To study the urine bacterial-viral associations in uncomplicated recurrent infections of the lower urinary tract (LUT).</p></sec><sec><title>Materials and methods</title><p>Materials and methods. The study included 14 patients with uncomplicated recurrent infections of the LUT, the average age was 33.0 ± 4.7 years. The object of the study was the average portion of morning urine collected prior to the appointment of empirical antibiotic therapy. Urine was divided into 3 aliquots: 1 for general urine analysis, 2 for bacteriological examination, 3 for polymerase chain reaction (PCR).</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. Aerobic-anaerobic associations were found in urine in all cases. Enterobacteriaceae family representatives were discovered in 92.8% of cases; they were represented by E. coli (78.6%), Klebsiella spp. (14.2%), Proteus spp. (7.1%). Moreover, in one patient at the same time (7.1%) E. coli + Klebsiella spp was isolated from urine.</p><p>The gram-positive microflora pattern consisted of 7 genera and / or species and in various combinations was found in all patients. The taxonomic structure of the gram-positive flora was represented by E. faecalis (64.3%), S. lentus (21.4%), Corynebacterium spp., S. warneri, E. faecium (14.3% each), S. epidermidis + E. coli was recorded in 4 (28.6%) women, E. faecalis + E. faecium + E. coli + Klebsiella spp. - in 1 (7.1%), E. faecalis + E. faecium + E. coli also in 1 (7.1%) patients.</p><p>Non-clostridial anaerobic bacteria (NAB) were isolated from urine in all cases with Eubacterium spp dominating. (57.1%). The taxonomic structure of NAB was represented by 5 genera: Eubacterium spp., Peptostreptococcus spp., Peptococcus spp., Bifidobacterium spp., Propionibacterium spp.</p><p>Viruses were detected in urine in 6 (42.9%) patients. Epstein-Barr virus (EBV) was detected in 4 (28.6%) of them, moreover, in 1 case, in association with human papillomavirus (HPV53), in two other cases (7.1% each), cytomegalovirus (CMV) was verified and human herpes simplex virus type 6 (HHV6), respectively.</p></sec><sec><title>Conclusions</title><p>Conclusions. In patients with uncomplicated recurrent LUTI, viruses with a prevalence of EBV were verified in urine in 42.9% of cases (28.6%). Apparently, the treatment of this patients` cohort should be directed not only to the bacterial, but also the viral components of the urinary microbiota.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>неосложнённые рецидивирующие инфекции</kwd><kwd>нижние мочевые пути</kwd><kwd>микробиота</kwd><kwd>микробные взаимосвязи</kwd><kwd>виробиота</kwd><kwd>вирусы</kwd><kwd>метагеномное секвенирование</kwd><kwd>культуральное исследование мочи</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>uncomplicated recurrent infections</kwd><kwd>lower urinary tract</kwd><kwd>microbiota</kwd><kwd>microbial relationships</kwd><kwd>virobiota</kwd><kwd>viruses metagenomic sequencing</kwd><kwd>urine culture</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Исследование выполнено в рамках государственного задания «Вирусурия и её этиологическое значение в развитии инфекции мочевых путей (ИМП)», № АААА-А18-118013090197-8 от 30.01.2018 года. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The study was carried out as part of the state scientific assignment «Virusuria and its etiological value in the development of urinary tract infection (UTI)», No. AAAA-A18-118013090197-8 of 01.30.2018. The authors have declared no conflicts of interest.</funding-statement></funding-group></article-meta></front><body><sec><title>Введение</title><p>На сегодняшний день, на наш взгляд, сложилась несколько тупиковая си­туация по ведению и лечению паци­ентов, а чаще это женщины, с неосложнённой рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей (НРИНМП). Антибактериальная терапия (АБТ) имеет низкую эффективность, причина которой многофакторна [1, 2]. В 2018 году Гайдлайн EAU [<xref ref-type="bibr" rid="cit3">3</xref>] содержал две, на наш взгляд, вза­имоисключающие рекомендации: «у пациентов с типичными симптомами неосложнённого ци­стита анализ мочи (посев на стерильность, ана­лиз тест-полоской) имеет ограниченную диа­гностическую ценность», а с другой стороны «у женщин с симптомами неосложнённого цисти­та диагностически значимым является уровень бактериурии ≥103 КОЕ/мл (УД3).</p><p>Первая мысль вызывает массу вопросов. Как странно звучит сочетание слов «посев на стерильность»! Если признать, что к 2018 году всем, наконец, стало известно о нестерильно- сти мочи здоровых людей [<xref ref-type="bibr" rid="cit4">4</xref>], то понятно, что со стороны EAU это неудачная игра слов и дефини­ций. Тем не менее, несмотря, на ограниченность диагностических тестов, уровень бактериурии в Гайдлайне 2018 года все-таки приводился. В рекомендациях EAU 2019 года [<xref ref-type="bibr" rid="cit5">5</xref>] уже не найти уровень диагностически значимой бактериурии и «точный диагноз неосложнённого цистита мо­жет быть основан на прицельном анализе сим­птомов нижних мочевых путей при отсутствии вагинальных выделений и болезненности» (УД 2b). При этом, к сильному уровню доказатель­ности относят: «посев мочи в следующих случа­ях: при наличии симптомов, которые не прохо­дят или рецидивируют в течение 4 недель после завершения лечения, у женщины с атипичными симптомами, у беременных». Очень сложно сказать насколько этот вариант рекомендации повысит эффективность лечения НРИНМП. Во- первых, достаточно сложно оценить пациента, у которого симптомы не проходят в течение меся­ца, и пациент ждёт следующего шага врача в его обследовании. Во-вторых, сложность в обследо­вании и лечении пациентов с НРИНМП связана ещё и с тем, что в этиологической структуре за­болевания остаются недоизученными бактери­альная, вирусная и другие составляющие.</p><p>Мы неоднократно писали о том, что «зато- ченность» исследователей только на представи­телях семейства Enterobacteriaceae - это тупи­ковый путь в изучении данной проблемы. При наличии в макроорганизме человека в норме 100 триллионов бактерий [<xref ref-type="bibr" rid="cit6">6</xref>] сложно предпо­ложить, что только энтеробактерии обусловли­вают развитие НРИНМП. На сегодняшний день многие исследователи пишут о роли грампо- зитивной, анаэробной микрофлоры и вирусов в этиологической структуре инфекций нижних мочевых путей [7-9].</p><p>Цель исследования: изучить бактериально­вирусные ассоциации мочи при неосложнённой рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>В пилотное исследование вошли 14 паци­енток с НРИНМП, средний возраст - 33,0 + 4,7 года. Критерии включения: наличие в анамнезе клинических проявлений рецидивирующей ин­фекции нижних мочевых путей, наличие двух обострений в течение 6 месяцев или трёх реци­дивов в течение 1 года, отсутствие заболеваний, передающихся половым путём в анамнезе и на момент исследования, согласие обследуемых на участие в исследовании. Объектом исследо­вания являлась средняя порция утренней мочи, собранной после соответствующей гигиениче­ской процедуры, до назначения эмпирической АБТ в стерильный одноразовый контейнер Ster­ile Uricol (for urine sample collection, overflow­ing capacity 50 ml, «HiMedia»). Мочу делили на 3 аликвоты: 1 - для общего анализа мочи, 2 - для бактериологического исследования, 3 - для постановки полимеразной цепной реакции (ПЦР). Бактериологическое исследование мочи проводили на основании клинических рекомен­даций (2014) [<xref ref-type="bibr" rid="cit10">10</xref>], но с применением расширен­ного набора различных питательных сред для культивирования факультативно-анаэробных (ФАБ) и неклостридиальных анаэробных (НАБ) бактерий [11, 12]. Определение вирусных аген­тов осуществляли методом ПЦР с детекцией в режиме «реального времени». Выделение ДНК производили сорбционным методом с исполь­зованием набора «АмплиПрайм ДНК-сорб-В» («НекстБио») из образцов мочи, с предвари­тельным концентрированием (центрифугиро­вание 5 минут при 10000g). Для выявления ДНК герпесвирусов человека типов 1, 2, 4, 5, 6, 7, 8 использовали наборы реагентов: «АмплиСенс® EBV/CMV/HHV6-cкрин-FL», (ФБУН ЦНИИЭ Ро­спотребнадзора), «HSV1/HSV2/CMV ГерпесКом- плекс», «Набор реагентов HHV8 для выявления ДНК вируса герпеса человека 8 типа» («ДНК- технология»), «Human Herpes virus 7 GenPak DNA-Fluo PCR test» (НПФ «Генлаб»). Определе­ние ДНК вируса папилломы человека (HPV 6, 11, 16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 44, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 66, 68, 73, 82) осуществляли набором реагентов «HPV квант-21» (ДНК-технология), поиск ДНК Parvovirus B19 выполняли набором «АмплиСенс® Parvovirus B19-FL» (ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора).</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>В моче во всех случаях обнаружены аэробно­анаэробные ассоциации. Представители семей­ства Enterobacteriaceae регистрировали в 92,8% наблюдений, они были представлены E. coli (78,6%), Klebsiella spp. (14,2%), Proteus spp. (7,1%). Причём у одной пациентки одновременно (7,1%) из мочи выделяли E. coli + Klebsiella spp. Средний уровень бактериурии для энтеробактерий соста­вил 104,4 КОЕ/мл с размахом колебаний от 102,0 КОЕ/мл до 107,0 КОЕ/мл.</p><p>Паттерн грампозитивной микрофлоры состо­ял из 7 родов и/или видов и в различных комби­нациях его обнаруживали у всех пациенток. Так - сономическая структура грампозитивной флоры была представлена: E. faecalis (64,3%), S. lentus (21,4%), Corynebacterium spp., S. warneri, E. fae- cium (по 14,3%), S. epidermidis + E. coli регистри­ровали у 4 (28,6%) женщин, E. faecalis + E. faecium + E. coli + Klebsiella spp. - у 1 (7,1%), E. faecalis + E. faecium + E. coli также у 1 (7,1%) пациентки.</p><p>Неклостридиальные анаэробные бактерии (НАБ) выделяли из мочи во всех наблюдениях при доминировании Eubacterium spp. (57,1%). Таксономическая структура НАБ была представ­лена 5 родами: Eubacterium spp., Peptostrepto- coccus spp., Peptococcus spp., Bifidobacterium spp., Propionibacterium spp.</p><p>Вирусы выявили в моче у 6 (42,9%) пациен­ток. У 4 (28,6%) из них обнаружен вирус Эпштей­на-Барра (EBV), причём в 1 случае в ассоциации с вирусом папилломы человека (HPV53), в двух других случаях (по 7,1%) верифицировали цитомегаловирус (CMV) и вирус герпеса человека типа 6 (HHV6) соответственно.</p><p>Приводим примеры ассоциаций бактерий и вирусов у пациенток с НРИНМП (табл. 1).</p><p> </p><table-wrap id="table-1"><caption><p>Таблица 1. Результаты бактериологического и ПЦР исследований</p><p>Table 1. The results of bacteriological and PCR studies</p><p>Примечания: EBV - вирус Эпштейна-Барр, HHV6 - вирус герпеса человека типа 6, HPV53 - вирус папилломы человека тип 53, CMV - цитомегаловирус</p><p>Notes: EBV - Epstein-Barr virus, HHV6 - human herpes simplex virus type 6, HPV53 - human papillomavirus type 53, CMV- cytomegalovirus</p></caption><table><tbody><tr><th>№</th><th>Возраст
Age</th><th>Аэробы / Aerobes</th><th>Анаэробы / Anaerobes</th><th>Вирусы
Viruses</th></tr><tr><th>Микроорганизмы
Microorganisms</th><th>Концентрация (КОЕ / мл)
Microbial load (CFU / ml)</th><th>Микроорганизмы
Microorganisms</th><th>Концентрация (КОЕ / мл)
Microbial load (CFU / ml)</th></tr><tr><td>1</td><td>22</td><td>E. coli</td><td>106,0</td><td>Peptococcus spp.</td><td>102,0</td><td>CMV</td></tr><tr><td>2</td><td>26</td><td>E. coli</td><td>106,0</td><td>Peptostreptococcus spp.</td><td>102,0</td><td>EBV</td></tr><tr><td>3</td><td>18</td><td>E. coli
Corynebacterium spp.
S. warneri
E. faecalis</td><td>102,0
102,0
102,0
102,0</td><td>Eubacterium spp. Peptococcus spp.</td><td>106,0
102,0</td><td>EBV</td></tr><tr><td>4</td><td>19</td><td>E. coli</td><td>107,0</td><td>Peptostreptococcus spp.</td><td>102,0</td><td>EBV +
HPV53</td></tr><tr><td> </td><td> </td><td>S. lentus</td><td>102,0</td><td>Eubacterium spp.</td><td>106,0</td></tr><tr><td>5</td><td>29</td><td>E. faecalis
Klebsiella spp.</td><td>102,0
102,0</td><td>Peptococcus spp.</td><td>102,0</td><td>HHV6</td></tr><tr><td>6</td><td>23</td><td>E. coli
S. lentus</td><td>103,0
103,0</td><td>Eubacterium spp.</td><td>105,0</td><td>EBV</td></tr><tr><td> </td><td> </td><td>E. faecalis</td><td>102,0</td><td>Propionibacterium spp.</td><td>102,0</td></tr></tbody></table></table-wrap></sec><sec><title>Обсуждение</title><p>В данном пилотном исследовании мы под­робно привели результаты тех пациенток с НРИНМП, у которых в моче обнаружены вирусы.</p><p>Мы хотим обратить внимание, что вирусы вери­фицированы в моче молодых женщин в возраст­ном диапазоне от 18 до 29 лет. В проведённой ранее работе по исследованию вирусо-бактериальных ассоциаций в моче здоровых женщин (n=20) лишь у одной обследуемой (5,0%) в воз­расте 43 лет были верифицированы HHV6 [<xref ref-type="bibr" rid="cit13">13</xref>]. При НРИНМП мы наблюдаем совсем другую ситуацию - доминирование в моче EBV. Ана­лизируя бактериальную составляющую микро­биоты мочи, вырисовывается картина сужения бактериального спектра микроорганизмов, ве­рифицированного в моче при НРИНМП. Так, у здоровых людей в моче обнаружено 27 родов и/или видов микроорганизмов, а при НРИНМП - всего 15 (p&lt;0,05). Причём, в норме представи­тели семейства Enterobacteriaceae были пред­ставлены E. coli (10,0%), Klebsiella spp., Proteus spp. (по 5,0%), Enterobacter spp., Citrobacter spp. (по 2,5%). А в настоящем пилотном исследо­вании доминирующим видом явилась E. coli (78,6%), реже регистрировали Klebsiella spp. и Proteus spp. (14,2% и 7,1% соответственно). Об­ращает на себя внимание значимо (p&lt;0,05) уз­кий спектр НАБ в моче пациенток с РНИНМП (5 родов) по сравнению со здоровыми женщина­ми (12 родов). </p><p>Если проанализировать приведённые дан­ные по верификации вирусо-бактериальных ас­социаций в моче пациенток с НРИНМП, то воз­никает несколько вопросов. Во всех случаях в моче верифицированы каузативные патогены: энтеробактерии и/или энтерококки и вирусы. Так вот, на что должно быть направлено лечение, в первую очередь, на какую составляющую - бактериальную или вирусную, или на обе одно­временно, или что-то можно игнорировать? Какой патоген явился триггером инфекционно­воспалительного процесса? Какое значение в приведённых микробных композициях имеют неклостридиальные анаэробные микроорга­низмы? Они немые свидетели развивающейся драмы или же соучастники очередного рециди­ва?</p><p>Бесспорно, вопросов много, а кто имеет от­веты? Наши дальнейшие исследования будут направлены на увеличение когорты обследуе­мых, проведение морфологических исследова­ний биоптатов мочевого пузыря, анализ резуль­татов различных вариантов терапии.</p><p>К сожалению, в рекомендациях EAU 2019 года не отражены персонифицированные под­ходы к обследованию и лечению этой очень сложной когорты пациенток.</p></sec><sec><title>Выводы</title><p>У пациенток с неосложнённой рецидиви­рующей инфекцией нижних мочевых путей в 42,9% случаев в моче верифицированы вирусы с доминированием EBV (28,6%). Лечение данной когорты пациенток, по-видимому, должно быть направлено не только на бактериальный, но и вирусный компоненты микробиоты мочи.</p></sec></body><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Палагин И.С., Сухорукова М.В., Дехнич А.В., Эйдельштейн М.В., Перепанова Т.С., Козлов Р.С. и исследовательская группа «ДАРМИС-2018». Антибиотикорезистентность возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового исследования «ДАРМИС-2018». Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):134- 146. DOI: 10.36488/cmac.2019.2.134-146</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Palagin I.S., Sukhorukova M.V., Dekhnich A.V., Edelstein M.V., Perepanova T.S., Kozlov R.S. and “DARMIS-2018” Study Group* Antimicrobial resistance of pathogens causing community-acquired urinary tract infections in Russia: results of multicenter study “DARMIS-2018”. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2019;21(2):134-146. (In Russ.). DOI: 10.36488/cmac.2019.2.134-146</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рафальский В.В. Антибиотикорезистентность возбудителей неосложненных инфекций мочевых путей в Российской Федерации. Вестник урологии. 2018;6(3):50-56. DOI: 10.21886/2308-6424-2018-6-3-50-56</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rafalsky V.V. Antibiotic resistance of pathogens causing uncomplicated urinary tract infections in Russian Federation. Urology Herald. 2018;6(3):50-56. (In Russ.). DOI: 10.21886/2308-6424-2018-6-3-50-56</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Urological InfecTIons. EAU Guidelines 2018. Доступно по: https://uroweb.org/guideline/urological-infecTIons/?type= archive Ссылка активна на 07.11.2019</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Urological Infections. EAU Guidelines 2018. Available at: https://uroweb.org/guideline/urological-infections/?type= archive Accessed November 07, 2019.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Набока Ю.Л., Гудима И.А. Коган М.И., Черницкая М.Л. Микробный спектр мочи молодых здоровых женщин. Урология. 2010;5:7-10. eLIBRARY ID: 15242297</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Naboka Yu.L., Gudyma I.A., Kogan M.I., Chernitskaya M.L. Bacterial spectrum of the urine in young healthy women. Urologiia. 2010;5:7-10. (In Russ.). eLIBRARY ID: 15242297</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Urological InfecTIons. EAU Guidelines 2019. Доступно по: hTTps://uroweb.org/guideline/urological-infecTIons/ Ссылка активна на 07.11.2019</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Urological Infections. EAU Guidelines 2019. Available at: https://uroweb.org/guideline/urological-infections/ Accessed November 07, 2019.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">NIH Human Microbiome Project. Доступно по: https://hmpdacc.org/hmp/ Ссылка активна на 07.11.2019.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">NIH Human Microbiome Project. Available at: hTT ps://hmpdacc. org/hmp/ Accessed November 07, 2019.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Крахоткин Д.В., Иванов С.Н., Набока Ю.Л., Коган М.И., Гудима И.А., Ильяш А.В., М.Э. Савкин, В.В. Красулин, Д.В. Сизякин. Вирусные патогены при урологических заболеваниях. Медицинский вестник Юга России. 2018;9(4):14- 21. DOI 10.21886/2219-8075-2018-9-4-14-21</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Krakhotkin D.V., Ivanov S.N., Naboka Y.L., Kogan M.I., Gudima I.A., Ilyash A.V., M.Е. Savkin, V.V. Krasulin, D.V. Sizya kin. Viral pathogens in urological diseases. Medical Herald of the South of Russia. 2018;9(4):14-21. (In Russ.). DOI 10.21886/2219-8075-2018-9-4-14-21</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Набока Ю.Л., Коган М.И., Васильева Л.И., Гудима И.А., Мирошниченко Е.А., Ибишев Х.С. Бактериальная микстинфекция у женщин с хроническим рецидивирующим циститом. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2011;1:8-12. eLIBRARY ID: 19059389</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Naboka Yu.L., Kogan M.I., Vasilyeva L.I., Gudima I.A., Miroshnichenko E.A., Ibishev Kh.S. Bacterial mixed i infecTIon in women with chronic recurrent cystitis. Zhurnal mikrobiologii, jepidemiologii i immunobiologii. 2011;1:8-12. (In Russ.). eLIBRARY ID: 19059389</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ибишев Х.С., Крахоткин Д.В., Васильев А.А., Крайний П.А. Рецидивирующая инфекция нижних мочевых путей вирусной этиологии. Вестник урологии. 2017;5(1):26-31. DOI: 10.21886/2308-6424-2017-5-1-26-31</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ibishev H.S., Krakhotkin D.V., Vasiliev A.A., Krayniy P.A. Viral eTIology of recurrent urinary tract infecTIons. Herald Urology. 2017;5(1):26-31. (In Russ.). DOI: 10.21886/2308-6424- 2017-5-1-26-31</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Козлов Р.С., Меньшиков В.В., Михайлова В.С., Шуляк Б.Ф., Долгих Т.И., Круглов А.Н., Алиева Е.В., В.Е. Маликова. Бактериологический анализ мочи: клинические рекомендации. М., 2014.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kozlov R.S., Men’shikov V.V., Mihajlova V.S., Shuljak B.F., Dolgih T.I., Kruglov A.N., Alieva E.V., V.E. Malikova. Bacteriological exanimaTIon of urine: clinical guidelines. Moscow, 2014. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Патент РФ на изобретение № 2452773/ 10.06.2012 Бюл. № 16. Набока Ю.Л., Коган М.И., Гудима И.А. Ковалева Е.А., Ибишев Х.С., Васильева Л.И., Газаев З.И., Остапенко Н.С. Способ определения бактериологической обсемененности мочи, секрета предстательной железы, эякулята. Доступно по: https://patents.s3.yandex. net/RU2452773C1_20120610.pdf Ссылка активна на 07.11.2019.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Patent RF na izobretenie № 2452773/ 10.06.2012 Bjul. № 16. Naboka Ju.L., Kogan M.I., Gudima I.A. Kovaleva E.A., Ibishev H.S., Vasil’eva L.I., Gazaev Z.I., Ostapenko N.S. Sposob opredelenija bakteriologicheskoj obsemenennosti mochi, sekreta predstatel’noj zhelezy, jejakuljata. (In Russ.). Available at: https://patents.s3.yandex.net/ RU2452773C1_20120610.pdf Accessed November 07, 2019.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Патент РФ на изобретение 2452774/10.06.2012 Бюл. № 16. Набока Ю.Л., Коган М.И., Гудима И.А., Мирошниченко Е.А., Ибишев Х.С., Брагина Л.Е., Фирзаули А.Х., Джалагония О.Т. Способ определения бактериологической обсеменённости мочи, секрета предстательной железы, эякулята. Доступно по: https://patents.s3.yandex. net/RU2452774C1_20120610.pdf Ссылка активна на 07.11.2019.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Patent RF na izobretenie 2452774/10.06.2012 Bjul. № 16. Naboka Ju.L., Kogan M.I., Gudima I.A., Miroshnichenko E.A., Ibishev H.S., Bragina L.E., Firzauli A.H., Dzhala-gonija O.T. Sposob opredelenija bakteriologicheskoj obsemenjonnosti mochi, sekreta predstatel’noj zhelezy, jejakuljata. (In Russ.). Available at: Accessed November 07, 2019.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Набока Ю.Л., Ильяш А.В., Крахоткин Д.В. Вирусо-бактеральные ассоциации, верифицированные в моче здоровых людей (пилотное исследование). Вестник урологии. 2018;6(3):44-49. DOI: 10.21886/2308-6424-2018-6-3-44-49</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Naboka Yu.L., Il’yash A.V., Krakhotkin D.V. Virus and bacterial associaTIons verifi ed in the urine of healthy subjects (pilot study). Urology Herald. 2018;6(3):44-49. (In Russ.). DOI: 10.21886/2308-6424-2018-6-3-44-49</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
